Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN1Q14699 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN1Q14699 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFTN1Q14699 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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