Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNA1Q09470 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNA1Q09470 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNA1Q09470 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms