Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 ADY2YCR010C 852 nt4.75□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 SLC1YDL052C 912 nt4.75□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 YDL124WYDL124W 939 nt4.75□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 RFC2YJR068W 1062 nt4.75□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 RPL21BYPL079W 483 nt4.75□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 MRPL36YBR122C 534 nt4.75□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 CNA1YLR433C 1662 nt4.75□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 SWC3YAL011W 1878 nt4.75□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 KEX1YGL203C 2190 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 STR2YJR130C 1920 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 TFA1YKL028W 1449 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 FMP30YPL103C 1407 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 YEL067CYEL067C 588 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 YGR273CYGR273C 525 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 SYN8YAL014C 768 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 PPA2YMR267W 933 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 SPS19YNL202W 879 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 MFM1YPL060W 1242 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 TRM44YPL030W 1704 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 VID22YLR373C 2706 nt4.74□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 GRC3YLL035W 1899 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 NAT2YGR147C 867 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 DAN1YJR150C 897 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 YRA2YKL214C 612 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 ATG14YBR128C 1035 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 ENT1YDL161W 1365 nt4.73□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 ABF1YKL112W 2196 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 RIM21YNL294C 1602 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 MSE1YOL033W 1611 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 COS7YDL248W 1152 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 YGR015CYGR015C 987 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 DAL3YIR032C 588 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 COS5YJR161C 1152 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 ARG1YOL058W 1263 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 GSP2YOR185C 663 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 ETR1YBR026C 1143 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 HRK1YOR267C 2280 nt4.72□□□□□ -1.65
CIK1Q01649 COX26YDR119W-A 201 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 TRS23YDR246W 660 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 NSE1YLR007W 1011 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 TFS1YLR178C 660 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YLR194CYLR194C 765 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 ORM2YLR350W 651 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YMR245WYMR245W 621 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 TEL1YBL088C 8364 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 COQ6YGR255C 1440 nt4.71□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 GDE1YPL110C 3672 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YDL034WYDL034W 345 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 RTN1YDR233C 888 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YDR417CYDR417C 372 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 CAB1YDR531W 1104 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 NAG1YGR031C-A 492 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 HSX1tR(CCU)J 72 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 VMA22YHR060W 546 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YLL059CYLL059C 507 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 CBC2YPL178W 627 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 SAC1YKL212W 1872 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 CDC6YJL194W 1542 nt4.7□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 TGL4YKR089C 2733 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 MUP3YHL036W 1641 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 MCM2YBL023C 2607 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 GCN20YFR009W 2259 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 FDC1YDR539W 1512 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 SCW4YGR279C 1161 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 SAE3YHR079C-A 276 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 GON7YJL184W 372 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 KTR2YKR061W 1278 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YET2YMR040W 483 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YIM1YMR152W 1098 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 MAP2YBL091C 1266 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 CKS1YBR135W 453 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 DCC1YCL016C 1143 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 PDR15YDR406W 4590 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 ICE2YIL090W 1476 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 SOF1YLL011W 1470 nt4.69□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 MPC54YOR177C 1395 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 MIF2YKL089W 1650 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 TPO2YGR138C 1845 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 GIR2YDR152W 798 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 MLC1YGL106W 450 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 YGL193CYGL193C 312 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 TRX2YGR209C 315 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 FMP33YJL161W 543 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 MRT4YKL009W 711 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 DAL82YNL314W 768 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 REG2YBR050C 1017 nt4.68□□□□□ -1.66
CIK1Q01649 CBP3YPL215W 1008 nt4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms