Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RUNX1Q01196 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms