Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNB1P98172 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EFNB1P98172 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFNB1P98172 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.4 ms