Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HERV-K104P61576 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERV-K104P61576 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms