Protein–RNA interactions for Protein: P58417

NXPH1, Neurexophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH1P58417 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPH1P58417 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPH1P58417 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXPH1P58417 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH1P58417 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms