Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC10P48553 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAPPC10P48553 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms