Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GLI4P10075 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GLI4P10075 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GLI4P10075 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GLI4P10075 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GLI4P10075 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GLI4P10075 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI4P10075 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI4P10075 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI4P10075 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI4P10075 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI4P10075 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI4P10075 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI4P10075 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GLI4P10075 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI4P10075 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GLI4P10075 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms