Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM3P06753 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM3P06753 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM3P06753 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM3P06753 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM3P06753 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM3P06753 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM3P06753 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM3P06753 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM3P06753 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM3P06753 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM3P06753 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM3P06753 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM3P06753 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM3P06753 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM3P06753 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM3P06753 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TPM3P06753 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM3P06753 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM3P06753 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM3P06753 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM3P06753 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM3P06753 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM3P06753 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM3P06753 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM3P06753 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM3P06753 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM3P06753 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM3P06753 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM3P06753 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM3P06753 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM3P06753 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM3P06753 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM3P06753 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM3P06753 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM3P06753 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM3P06753 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms