Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPN1P04843 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN1P04843 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN1P04843 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN1P04843 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN1P04843 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPN1P04843 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPN1P04843 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN1P04843 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN1P04843 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN1P04843 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN1P04843 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPN1P04843 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPN1P04843 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPN1P04843 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPN1P04843 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPN1P04843 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPN1P04843 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPN1P04843 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPN1P04843 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPN1P04843 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPN1P04843 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms