Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP3BO95985 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TOP3BO95985 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TOP3BO95985 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms