Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL3O95236 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL3O95236 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL3O95236 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APOL3O95236 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOL3O95236 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APOL3O95236 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOL3O95236 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOL3O95236 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOL3O95236 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOL3O95236 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
APOL3O95236 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOL3O95236 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOL3O95236 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APOL3O95236 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APOL3O95236 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APOL3O95236 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APOL3O95236 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL3O95236 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL3O95236 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL3O95236 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL3O95236 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL3O95236 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
APOL3O95236 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOL3O95236 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms