Protein–RNA interactions for Protein: O60869

EDF1, Endothelial differentiation-related factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDF1O60869 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDF1O60869 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EDF1O60869 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EDF1O60869 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EDF1O60869 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDF1O60869 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EDF1O60869 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDF1O60869 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDF1O60869 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDF1O60869 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDF1O60869 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDF1O60869 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDF1O60869 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDF1O60869 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDF1O60869 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDF1O60869 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDF1O60869 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDF1O60869 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDF1O60869 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms