Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCO2O43819 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCO2O43819 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCO2O43819 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCO2O43819 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCO2O43819 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCO2O43819 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCO2O43819 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCO2O43819 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCO2O43819 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCO2O43819 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCO2O43819 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCO2O43819 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCO2O43819 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCO2O43819 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCO2O43819 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCO2O43819 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCO2O43819 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms