Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXN3O00409 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FOXN3O00409 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms