Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT87PA6NCN2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT87PA6NCN2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT87PA6NCN2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms