Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN7Q9Y6W3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN7Q9Y6W3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN7Q9Y6W3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms