Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHGA8Q9Y5G5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHGA8Q9Y5G5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms