Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCTD3Q9Y597 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCTD3Q9Y597 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCTD3Q9Y597 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms