Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LEMD3Q9Y2U8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LEMD3Q9Y2U8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms