Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR6Q9Y2C9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR6Q9Y2C9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR6Q9Y2C9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms