Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS3Q9UPU3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS3Q9UPU3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms