Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG4Q9UBN1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG4Q9UBN1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms