Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPHK1Q9NYA1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPHK1Q9NYA1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPHK1Q9NYA1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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