Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAJC17Q9NVM6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAJC17Q9NVM6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.5 ms