Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC177Q9NQR7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC177Q9NQR7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC177Q9NQR7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms