Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HPS4Q9NQG7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HPS4Q9NQG7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HPS4Q9NQG7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms