Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZCCHC17Q9NP64 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZCCHC17Q9NP64 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms