Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB55

CYP3A43, Cytochrome P450 3A43, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A43Q9HB55 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CYP3A43Q9HB55 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CYP3A43Q9HB55 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms