Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NANOGQ9H9S0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NANOGQ9H9S0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms