Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM3Q9BZL3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM3Q9BZL3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms