Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CELF4Q9BZC1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CELF4Q9BZC1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CELF4Q9BZC1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms