Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PACSIN1Q9BY11 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PACSIN1Q9BY11 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms