Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP85Q9BW27 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP85Q9BW27 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP85Q9BW27 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms