Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRNP25Q9BV90 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRNP25Q9BV90 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRNP25Q9BV90 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.7 ms