Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TWNKQ96RR1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TWNKQ96RR1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 353.2 ms