Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SENP8Q96LD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SENP8Q96LD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms