Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPNS2Q96L46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPNS2Q96L46 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms