Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERAC1Q96JX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERAC1Q96JX3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms