Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TM4SF19Q96DZ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TM4SF19Q96DZ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM4SF19Q96DZ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms