Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2H4Q92759 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H4Q92759 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms