Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A1Q8WWI5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC44A1Q8WWI5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC44A1Q8WWI5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms