Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF3Q8N9W5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAAF3Q8N9W5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAAF3Q8N9W5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms