Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PELI3Q8N2H9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PELI3Q8N2H9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms