Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKAP1Q86WV1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKAP1Q86WV1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SKAP1Q86WV1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms