Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J8

UBE3D, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3DQ7Z6J8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3DQ7Z6J8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3DQ7Z6J8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3DQ7Z6J8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3DQ7Z6J8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3DQ7Z6J8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3DQ7Z6J8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3DQ7Z6J8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3DQ7Z6J8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE3DQ7Z6J8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE3DQ7Z6J8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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