Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC39A4Q6P5W5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC39A4Q6P5W5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms