Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFAIP8L3Q5GJ75 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms