Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIF1AQ16665 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIF1AQ16665 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms